在一次航海旅行中，少年御景风对一种名为“索多玛的苹果”的毒品紧迫不舍，与他一起参与整个事件的少女橘真绫也对他的真实身份产生了好奇与疑惑，与此同时，一连串神秘的死亡事件频频发生……随后，令御景风更为惊讶的是，一个名为“STH”的神秘程序总是被人反复提起，而因追逐STH秘密而亡故的人越来越多。这个程序到底隐藏着怎样的秘密？它和御景风从不愿意多提的身世有着怎样的联系？接下来的变故与转折，御景风和超级骇客杰比又该怎样面对？亦正亦邪的神秘少年御景风到底会路向何方?于索多玛城内幻化的苹果到底象征的是希望还是失望？一在劫数与结束来临之前一切已然开始……